事的传奇天皇驾崩了，在位十六年，享年五十四岁。随后被追号后花山院，葬于月轮陵。

不同于之前的天皇，新天皇还听从秀保的意见，为其上汉风谥号“光华”，这是自光孝天皇（887）之后，正常驾崩的天皇中加汉风谥号的第一位，也是时隔四百年后再次出现汉风谥号的天皇。

同月，满仁于京都御所践祚，因驾崩后上谥号“孝明”，故后世多称其为“孝明天皇”。即位当日便尊秀保为上皇，因秀保此时已于北山，即原足利义满北山殿改造的鹿苑寺（别称金阁寺）附近修建新御所东明殿，故上院号“东明院”，所颁命令皆称院旨。

同时，立若宫佑仁亲王为东宫，定明年改年号“皇统”。

为巩固皇权，朝廷在东明院的主导下进行了一系列的改革，史称“皇统革新”。

首先便是从制度上重新确定天皇和朝廷的权威，令以心崇传与藤堂高虎在幕府《武家诸法度》及《禁中并公家诸法度》等制度基础上，制定颁布《改新之诏》和《政体书》，主要规定：

1.天下权力，总归天皇；

2.幕府权力和职能全部转移至朝廷，各藩对幕府的责任和效忠也随之转移；

3.普天之下莫非王土，率土之滨莫非王臣，废除“士、农、工、商”制度，将皇室亲缘关系者列为“皇族”，公卿和大名列为“华族”，原幕府和大名家臣、武士列为“士族”，其他从事农、工、商的和底层贱民列为“平民”，位有尊卑，但各等级间允许相互交往；

4.规定太政大臣、关白、征夷大将军位列华族之上、皇族之下，但为虚衔且不常设，其中摄关家和清华家可担任太政大臣和关白，东宫兼任征夷大将军，下设三护国将军，分别由贤仁、清仁、兴仁亲王一脉担任，负责维护各方治安，所需兵权经天皇同意后，由征夷大将军授予；

5.爵位、官职改革：

爵位方面：

按高低分为王、公、侯、伯、君，其中王分为亲王（内）、郡王（内），只能分封皇族（含臣籍降下者），如贤仁，因封地在近江，被封为江亲王，居城也就成为宫号，即“坂本宫”（后来宫号逐渐废除，只保留爵位名）；

公分为兴国公、安国公、辅国公；

侯分为兴郡侯、安郡侯、辅郡侯；

伯分为兴县伯、安县伯、辅县伯；

君不再细分。

皇族中，除了东宫和世子外，

天皇嫡子女封亲王、内亲王，庶子女封郡王、内郡王；

亲王嫡子女封郡王、内郡王，庶子女封安国